Badanie zaczyna się od wywiadu i ogólnego badania klinicznego. Kolejnym punktem są oględziny okolic jamy ustnej i głowy, omacywanie i opukiwanie zatok. Badanie wewnętrzne jamy ustnej ma na celu ocenę dziąseł, zębów, zgryzu najpierw wzrokowo. Następnie palpacyjnie sprawdza się czy są niewyrżnięte zęby, ślady urazów lub nieprawidłowości kostne. Wziernikowanie pozwala ocenić tkanki miękkie takie jak język, błony śluzowe, podniebienie, wargi, dziąsła, przedsionek jamy ustnej. Badanie szczegółowe zębów i ich ocena jako jednostki pozwala wykryć patologie poszczególnych zębów.